Die indonesische Sektion des Vereins besteht aus denjenigen Mitgliedern, die ihren Sitz, Wohnsitz oder gewöhnlichen Aufenthalt in Indonesien haben. Sie hat die Aufgabe, den Verein bei der Durchsetzung seiner Ziele in Indonesien und bei der Zusammenarbeit der Organe des Vereins zwischen Deutschland und Indonesien zu unterstützen. Sie hat ihren Sitz in Jakarta und ist vereinsrechtlich eigenständig.

Die enge inhaltliche Verflechtung kommt durch die wechselseitige Mitgliedschaft der Präsidenten der beiden Sektionen im Vorstand der jeweils anderen Sektion zum Ausdruck.

Durch gemeinsam organisierte und gestaltete Projekte, Veranstaltungen und Kooperationen wirken beide Sektionen auf die länderübergreifende Verständigung insbesondere im Gesundheitssektor hin. Neben den primären Vereinszielen gelingt dadurch ein Austausch über die Kulturen und Ländergrenzen hinweg.